Представители палестинской администрации предупреждают, что вопрос о месте захоронения Арафата может вызвать серьезный конфликт в отношениях между ПА и Израилем. Согласно одному из сообщений, все контакты между новым палестинским руководством и израильскими официальными лицами будут заморожены до тех пор, пока не будет получено разрешение похоронить Ясера Арафата в Иерусалиме.
Между тем, глава правительства Израиля Ариэль Шарон высказался в самой категоричной форме против этой идеи. В Израиле настаивают на том, чтобы председатель ПА был похоронен в Хан-Юнесе, где на кладбище есть участок, принадлежащий семье Арафат, и где уже покоятся несколько представителей этого семейства.
В настоящий момент по сообщению ряда источников Ясер Арафат пребывает в состоянии, называемом «смерть мозга». Функции кровообращения и дыхания в его теле поддерживаются при помощи приборов.