Информацию о том, что такие сотрудники поддерживают идеи насилия и действий террористов ХАМАСа, распространила ранее правозащитная произраильская группа «UN Watch». В БАПОР отреагировали на публикацию, отстранив от работы шестерых сотрудников. Среди отстраненных сотрудников – учительница из Иордании, призывавшая к «борьбе против евреев и их убийству», учитель из Ливана, считающий необходимым «уничтожать сионистов», и др. Сейчас такие сотрудники отправлены в неоплачиваемый отпуск.
БАПОР является работодателем примерно для тридцати тысяч человек. Агентство оказывает разного рода услуги примерно полутора миллионам так называемых палестинских беженцев в странах Ближнего Востока.